Contrat Loire et ses annexes : un fleuve en reconquête écologique

Le contrat Loire et ses annexes est un programme d’envergure pour redonner souffle au fleuve et à ses milieux naturels. Il allie restauration écologique, innovation technique et mobilisation collective. Le programme de rééquilibrage du lit de la Loire, cœur du contrat, cible trois secteurs d’intervention : Montjean - Ingrandes, Anetz - Oudon et Bellevue - Sainte-Luce-sur-Loire.

Témoignage

Photo d'Isabelle Le Strat

Isabelle Le Strat

© Jean-Louis Aubert

Isabelle Le Strat, chargée d’interventions milieux aquatiques et biodiversité - délégation Maine-Loire-Océan

« La reconquête de la Loire est un chantier au long cours. Elle améliore la résilience du fleuve et de ses milieux associés face aux pressions diverses et au dérèglement climatique. Ce projet contribue également à la préservation de la biodiversité. Il permet de reconnecter les habitants, usagers, acteurs locaux à leur fleuve. Ce programme n’a été possible que grâce à l’implication de tous les acteurs depuis de nombreuses années. »

Réconcilier le fleuve avec ses milieux naturels

Le fonctionnement de la Loire aval a été profondément modifié par plusieurs aménagements des XIXe et XXe siècles. Le lit du fleuve s’est creusé, les niveaux d’eau ont baissé. Dès les années 1990, le déséquilibre morphologique est constaté. Il faut agir. Une réflexion collective s’engage. Elle aboutit sur le programme de rééquilibrage du lit de la Loire. 

Les études s’enchaînent entre 2015 et 2020. Le contrat Loire et ses annexes 2021-2023 marque une nouvelle étape. Il incarne une volonté forte : restaurer le fonctionnement naturel du fleuve et de ses milieux associés – bras secondaires, boires, zones humides. Ce contrat territorial s’inscrit dans la dynamique du Plan Loire Grandeur Nature et de la stratégie Loire 2035. Il couvre 140 km entre Montsoreau et Nantes, dans le Maine-et-Loire et la Loire-Atlantique. 

Le second contrat, 2024-2026, réunit une quinzaine de partenaires. Il est piloté par l’agence de l’eau Loire-Bretagne et la Région Pays de la Loire. Voies navigables de France, Conservatoire d’espaces naturels, GIP Loire Estuaire, collectivités, syndicats de rivières, associations... tous sont mobilisés pour redonner à la Loire son rôle de corridor écologique majeur.

Des travaux concrets sur le terrain

Le programme de rééquilibrage du lit de la Loire, cœur du contrat, cible 3 secteurs d’intervention : Montjean - Ingrandes, Anetz - Oudon et Bellevue - Sainte-Luce-sur-Loire. Les interventions sont variées : suppression et remodelage d’épis, construction d’une digue immergée à Bellevue.

Travaux de rééquilibrage du lit de la Loire

Travaux de rééquilibrage du lit de la Loire

© Voies navigables de France – CHARIER, NGE

Depuis 2021, le programme de rééquilibrage du lit de la Loire, mené par voies navigables de France (VNF), est entré en phase opérationnelle avec le démarrage des travaux sur le secteur entre Montjean et Ingrandes.

À l’automne 2025, les travaux sont achevés sur le secteur de Montjean, bien avancés sur Bellevue et en cours sur Anetz. À Bellevue, une digue immergée recrée une zone de transition entre Loire estuarienne et Loire fluviale. Elle rehausse le fond du lit de 30 cm à 1 m selon les secteurs. Le niveau d’eau à l’étiage pourrait gagner jusqu’à 1,80 m à marée basse. Le courant est ralenti, le sable se dépose, les annexes se reconnectent.

Un volet ambitieux sur les annexes fluviales

Les annexes fluviales – boires, bras secondaires – sont restaurées pour favoriser le maintien d’une mosaïque d’habitats, reconnecter les milieux, lutter contre les espèces invasives et préserver la biodiversité. Parmi les sites concernés : boire Torse, bras de la Guesse, boire de Drain, bras des Vinettes…

Le Conservatoire d’espaces naturels et la ligue de protections de oiseaux (LPO) mènent un programme d’acquisition foncière pour préserver les fonctionnalités des zones humides, notamment sur les îles de Loire. Objectif : 106 hectares acquis d’ici 2026.

Afin de maintenir l’accès aux îles pour les éleveurs qui les entretiennent avec leurs animaux, deux bacs collectifs ont été construits. Les éleveurs ont été formés à leur navigation. VNF, le Conservatoire et la Région ont soutenu cette initiative, avec l’appui du Fonds Vert.

Un financement structurant pour un fleuve vivant

Les contrats pour la Loire et ses annexes 2021-2023 et 2024-2026 mobilisent des moyens financiers importants sur deux périodes successives : au total, plus de 63 millions d’euros pour restaurer la Loire et ses annexes entre Montsoreau et Nantes, sur une période de six ans.

Pour le rééquilibrage du lit de la Loire, VNF est maître d’ouvrage. L’agence de l’eau Loire-Bretagne engage 26,4 millions d’euros, soit 45 % du financement. Le conseil régional Pays-de-la-Loire finance 30 % sur le contrat 2024-2026. Le FEDER complète à hauteur de 20 %.

Un suivi scientifique pour mesurer les effets

Un programme de suivi écologique accompagne les travaux, coordonné par le GIP Loire Estuaire. Il s’appuie sur des techniques innovantes : télémétrie acoustique pour suivre les poissons migrateurs (lamproie, alose, anguille), ADN environnemental pour détecter les mollusques aquatiques, indicateurs hydrodynamiques pour mesurer les vitesses d’écoulement et les tirants d’eau.

Ces données permettent d’évaluer l’impact des travaux, d’ajuster les interventions et de documenter les bénéfices écologiques.

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